咳嗽的时候肾疼的原因可能是炎症或者肾结石等疾病的原因。1、如果在咳嗽的过程中出现肾疼，可能是因为身体感染或者出现炎症，可以使用抗生素或者一些止咳化痰的药物进行治疗，比如罗红霉素、氨茶碱或者甘草片等。如果病情比较严重，最好到医院进行胸片检查和血液常规检查。2、不同的人出现咳嗽酸疼的原因或许是不同的，有的人是因为出现了肾结石等疾病，可以考虑到医院的泌尿科做B超确认病情，可以根据肾结石的大小选择药物治疗或者手术治疗，应当多喝水，适当的运动有利于身体结石的排出，最好注意保持清淡的饮食方式。
