校车超载会被罚款并由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。
【法律依据】
《道路交通安全法》第四十九条规定，机动车载人不得超过核定的人数，客运机动车不得违反规定载货。第九十二条规定，公路客运车辆载客超过额定乘员的，处200元以上500元以下的罚款;超过额定乘员20%或者违反规定载货的，处500元以上2000元以下的罚款。有前两款行为的，由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。
运输单位的车辆有本条第一款、第二款规定的情形，经处罚不改的，对直接负责的主管人员处2000元以上5000元以下罚款。
