1、综合配套改革方面的政策支持，大胆试验，开拓创新，推进行政治理体制、市场体系、土地治理制度等综合配套改革，加快转变政府职能，创新经济区治理模式，深化投融资体制改革加大港口等资源整合力度等；
2、重大项目布局方面的政策支持，国家通过对有关规划、重大项目布局及项目审批、核准、备案等方面给予支持，鼓励东部地区带动和参与对广西北部湾经济区的整合力度；
3、保税物流体系方面的政策支持，国家支持北部湾经济区在符合条件的地区设立保税港区、综合保税区和保税物流中心，拓展出口加工区保税物流功能；
4、金融改革方面的政策支持，国家支持在北部湾地区设立地方性银行，探索设立产业投资基金和创业投资企业，扩大企业债券发行规模，支持符合条件的企业发行企业债券；
5、开放合作方面的政策支持，国家支持北部湾经济区发挥开放合作示范作用，建立和完善开放合作机制，加快实施合作项目。
