合伙企业的个税计算是以税前利润按各合伙人的股份比率计算出每个人分配的利润，扣除个税允许税前扣除额42000，而每月是3500，再然后再按个体工商户的生产经营所得和对企事业单位的承包经营、承租经营所得适要用5级累进个税税率表计算应缴的税额。
而用于计算个人所得税的基础是：合伙企业收入总额—生产经营成本费用、损失—费用扣除标准=应纳税所得，再用一个应纳税所得对应的税率表中的级次计算应缴纳多少个税。
【法律依据】
《企业所得税法》第五条规定，企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，为应纳税所得额。
