昭通境内群山林立，海拔差异较大，具有高原季风立体气候特征。昭通境内四季差异较小，但是不同的海拔上气候有着较大的差异，海拔从高到低有高原气候、温带气候、亚热带气候之分，而在同一海拔上，昭通南部温度比北部高，湿度比北部低。昭通全年平均气温在11℃至21℃之间，最冷气温出现在1月，月平均气温在1℃至12℃之间，最热温度出现在7月，月平均气温在20℃至27℃之间。昭通降水比较丰富，但是南北分布不均，南干北湿，涝灾和旱灾时有发生。
