疫情期间治疗医保的报销流程是：对新型冠状病毒感染的肺炎患者，坚持急事急办、特事特办，开通医保绿色通道，无论是否参保，是否办理转诊转院、是否办理异地就医备案手续，是否能异地联网结算，一律实行先救治后结算，由医保基金先行垫付费用，个人无需垫付。【法律依据】《中国人民共和国传染病防治法》第四十一条规定，在隔离期间，实施隔离措施的人民政府应当对被隔离人员提供生活保障；被隔离人员有工作单位的，所在单位不得停止支付其隔离期间的工作报酬。
