重庆江北机场目前有三个航站楼：一号航站楼负责国际和地区航班的值机、安检和进出港；二号航站楼主要负责四川航空、成都航空、海南航空、首都航空、天津航空、祥鹏航空、西部航空、南方航空、重庆航空的值机、安检和进出港；三号航站楼主要负责东方航空、上海航空、联合航空、厦门航空、华夏航空、河北航空、奥凯航空、春秋航空、吉祥航空、深圳航空、山东航空、鲲鹏航空、昆明航空、中国国际航空的值机、安检和进出港。
